随着高等教育的普及和学术竞争的日益激烈，研究生毕业论文的撰写和查重工作越来越重要。其中，论文查重是评估学术诚信和论文原创性的重要手段之一。然而，有些研究生可能会面临论文查重字数超过规定上限的问题，那么应该如何处理呢？

首先，研究生应该在写作过程中时刻注意留出一定的字数余量，以应对查重字数超限的情况。在撰写论文时，可以采取措施，比如尽量精简论文中的废话、冗余内容，提高行文的凝练度，以便在查重时节省字数。

其次，如果论文查重字数超出规定上限，研究生可以考虑对文中的重复内容进行删除或修改。通过检查论文结构和篇章逻辑，可以找出相似的段落或句子，并进行合理的删减或调整，以减少查重结果中的重复内容。

此外，如果研究生担心删除过多会影响论文的逻辑和结论，可以考虑对某些重复段落进行改写。通过调整语言表达方式、更换同义词或增加新的分析观点等方式，可以使重复内容变得更为独特，从而减少查重结果中的相似度。

最后，研究生还可以考虑采用查重系统提供的其他功能，例如设置一定比例的引用和参考文献，或者通过段落间的换句话等方式来改变查重结果的字数。

综上所述，研究生在论文查重字数超过规定上限时，可以通过合理减少和改写重复内容的方式来处理。同时，要时刻注意预留字数余量，并合理运用查重系统的功能，以确保论文在查重过程中符合要求。最重要的是，诚实守信地对待学术研究，遵守学术规范，保证论文的原创性和学术诚信。